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A missão do MARE é procurar a excelência no estudo dos ecossistemas aquáticos e disseminar este conhecimento para apoiar as políticas de desenvolvimento sustentável.
Esta missão é concretizada através da investigação científica, educação, transferência de conhecimento e de tecnologia para o setor produtivo e divulgação de Ciência, desenvolvidas em redes de colaboração estabelecidas ao nível regional, nacional e internacional.

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